Theo kết quả quan trắc, phân tích môi trường tại 17 tuyến kênh trên địa bàn tỉnh do Chi cục Thủy lợi phối hợp với Trung tâm Quan trắc và Phân tích môi trường, thuộc Sở Tài nguyên và Môi trường thực hiện; Hầu hết các tuyến kênh đều bị ô nhiễm, nhiều thông số vượt quy chuẩn cho phép về chất lượng nước mặt. 

Để giảm ô nhiễm, đảm bảo chất lượng nguồn nước phục vụ sản xuất nông nghiệp và dân sinh kinh tế, tạo sự phát triển bền vững, trước mắt trong giai đoạn tưới cây vụ đông và chuẩn bị ải vụ đông xuân tới đây, Sở Nông nghiệp và Phát triển nông thôn đề nghị UBND các huyện, thành phố, thị xã, các doanh nghiệp khai thác công trình thủy lợi thực hiện tốt các biện pháp phòng ngừa, xử lý vi phạm công trình thủy lợi và những hành vi gây ô nhiễm nguồn nước trên hệ thống kênh mương, sông trục nội đồng. Tiếp tục thực hiện đồng bộ các giải pháp để hạn chế ô nhiễm nguồn nước.

Ban Quản lý các khu công nghiệp, UBND các huyện, thị xã, thành phố tăng cường kiểm tra, chỉ đạo các khu công nghiệp, cụm công nghiệp thực hiện vận hành thường xuyên, ổn định hệ thống thu gom, xử lý nước thải theo đúng quy trình, đảm bảo chất lượng nước thải trước khi xả ra hệ thống công trình thủy lợi.

Công ty TNHH MTV Khai thác công trình thuỷ lợi Bắc Hưng Hải kiến nghị các tỉnh ở phía ở khu vực thượng lưu tăng cường kiểm tra, ngăn chặn, xử lý xả nước thải không đảm bảo chất lượng vào hệ thống công trình Bắc Hưng Hải.